2024年05月08日 更新
どうも、クラゲジュニアです。
以下の画像は、Blenderで3Dモデルを読み込み、カメラの位置や視点を調整してMaterial Previewで表示している様子です。

この状態で、背景なども削除した状態でPNGファイルに書き出す方法をご紹介します。
メニューからRender > Render Imageを選択し、その後のウィンドウで画像保存してみます。

保存された画像はこちらです。

残念ながら、たくさん問題点が出ました。
(参考)Blenderのバージョンは3.2.0で確認しています。
上記の場合は表示されていませんが、GizmosやOutlinesなどのオーバーレイを非表示にします。下図で囲んだアイコンをクリックすると非表示になります。

Render Propertiesアイコン > Film > Transparent にチェック

サブメニューのView > Viewport Render Imageをクリックします。

image > Save で画像を保存すれば完了です!

背景なしで透過PNGとして保存されていることも確認できました。

以上です。